Таинственные события в мире науки, противоречивые результаты экспериментов на ускорителях частиц и самоубийства ученых привлекают внимание компетентных органов. Нанотехнолог Ван Мяо соглашается участвовать в расследовании, т.к. ему повсюду видятся цифры с пугающим обратным отсчетом, которые исчезают лишь тогда, когда ученый прерывает свои исследования. Военные и спецслужбы полагают, что некто пытается затормозить научный прогресс на Земле. Ключом к разгадке становится компьютерная игра "Задача трех тел", к которой присоединяется герой. В результате расследования выясняется, что Земля находится в центре уже идущего инопланетного вторжения. По одноименному роману Лю Цысиня.
Действие сериала происходит на поздних этапах эпохи Воюющих царств. Многие влиятельные политики того времени действуют вместе, чтобы объединить шесть царств под одной властью. Империя Цинь становится первой династией Императорского Китая.